На 150 років до подій гри BlazBlue: Calamity Trigger, XBlaze Code: Embryo є візуальною новелою, яка розповідає про Тоую Кагарі, студента середньої школи, життя якого перевертається з ніг на голову, коли його атакує якийсь надприродний істота, а врятує його загадкова дівчина на ім'я Ес.